118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0240 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  353  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  76.4 
 
 		 179 aa  278  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 186 aa  253  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 186 aa  253  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 186 aa  253  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 198 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  37.21 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  36.16 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  32.4 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  34.44 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  32.6 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  32.76 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  35 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  31.35 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  36.25 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  32.2 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  34.3 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  30.82 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  33.33 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  30.39 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  31.54 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 323 aa  50.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  20.35 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  21.61 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  28.89 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  34.85 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 211 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  37.35 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  33.09 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  20.97 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 248 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 248 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 195 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 195 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 195 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 240 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>