130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4980 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  100 
 
 		 190 aa  360  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  43.03 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 195 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  39.55 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 216 aa  94.4  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 231 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  34.88 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 275 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 226 aa  44.7  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 246 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  25.16 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  29.41 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>