121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2000 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  65.96 
 
 		 198 aa  240  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  44.08 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  32.6 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  31.94 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  26.79 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 299 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 185 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  28.36 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 173 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  26.67 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  28.24 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  27.91 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  48.21 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  39.47 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  26.17 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>