95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5083 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  53.76 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 209 aa  130  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  26.92 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  25.15 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  29.88 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  25.62 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  26.11 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  30.72 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  29.19 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  25.99 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  23.2 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  38.71 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  24.21 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  25.78 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  24.41 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  30.11 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 425 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 420 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 400 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0048  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 252 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 228 aa  41.2  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 225 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>