40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3112 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6234  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.711722 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  28.72 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  28.72 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  28.72 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 333 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 341 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 378 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758.1  hypothetical protein  29.17 
 
 		 773 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 340 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  32.8 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>