78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3690 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 209 aa  107  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 232 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  34.15 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4250  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141169  normal  0.0239439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 324 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 218 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  35.06 
 
 		 204 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 187 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 228 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  34.74 
 
 		 233 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  51.06 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 183 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>