71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6310 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  48.63 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  28.48 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  29.38 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  28.73 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  30.57 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  29.21 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  29.21 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  27.43 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  32.18 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  34.32 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  27.41 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  30.11 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 231 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  26.19 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  31.85 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  27.57 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  23.56 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  28.07 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0215  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 189 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 187 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 200 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 173 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 199 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 200 aa  40.8  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  40.8  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>