229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8534 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  40.11 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  36.46 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  39.36 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  35.57 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  32.32 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  30.89 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 383 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  27.37 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  38.61 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  29.94 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.85 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  31.3 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.94 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  37.04 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 287 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>