60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2681 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 209 aa  111  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0096  transcriptional regulator  33 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  26.44 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  25.82 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  26.18 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 383 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  31.46 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  23.59 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  27.41 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  22.92 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 194 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 193 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0164  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 208 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  20.98 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 224 aa  41.2  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>