More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1030 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  45.79 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 383 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  43.78 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 185 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  41.81 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  34.69 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  43.23 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 194 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 194 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  32 
 
 		 217 aa  94.7  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  45.6 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  35.68 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  35.57 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  38.83 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  31.75 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  37.27 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  30.61 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  36.93 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  30.51 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  32.11 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>