240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1687 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  100 
 
 
266 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
187 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
194 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
194 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
194 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
204 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
206 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 
224 aa  94.7  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 
208 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 
204 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
383 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
205 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 
201 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 
208 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  30.89 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
192 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  37.35 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.63 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  28.85 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 
205 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
191 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 
214 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 
194 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
205 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 
202 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  36.07 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.24 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
216 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
216 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
216 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  37.2 
 
 
213 aa  72  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
206 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  34.48 
 
 
194 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  40.29 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  29.69 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  36.96 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
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NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 
201 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 
203 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
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NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
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