255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4685 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  396  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  47.21 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  40.56 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  46.79 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  34.92 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  33.73 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 383 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  32.34 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  32.14 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  40.93 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  34.3 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  33.94 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  48.31 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  39.31 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  35.12 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  29.71 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>