112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0251 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0251  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514546  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0223  putative transcriptional regulator, TetR family  87.57 
 
 
185 aa  333  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  62.84 
 
 
187 aa  241  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  55.74 
 
 
181 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  52.75 
 
 
181 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  54.35 
 
 
189 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  55.62 
 
 
209 aa  187  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3173  TetR family transcriptional regulator  61.21 
 
 
213 aa  184  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  53.55 
 
 
187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1889  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
195 aa  181  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1661  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 
180 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0333899  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  54.11 
 
 
173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  40.88 
 
 
202 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 
210 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  40.7 
 
 
203 aa  104  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
190 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1533  regulatory protein TetR  33.13 
 
 
203 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987298  normal  0.249923 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
201 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 
205 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
203 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  30.51 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
249 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
248 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
200 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 
203 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
200 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  26.67 
 
 
222 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 
214 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
383 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
192 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
214 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  26.42 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 
202 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1163  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370888  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  29.49 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
191 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
199 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
216 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
200 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
205 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
237 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  27.16 
 
 
266 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  26.79 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  26.21 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
209 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  37.5 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 
199 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
197 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325156 
 
 
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NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 
178 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
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