88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2465 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 202 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 202 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 202 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 220 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 197 aa  188  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  41.5 
 
 		 204 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  28.34 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.37 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  37.36 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  26.63 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 299 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 385 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 254 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 205 aa  42  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 212 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  29.13 
 
 		 251 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1252  regulatory protein, TetR  38.96 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.409819  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 216 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  24.34 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>