More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4083 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 236 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  29.29 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  30 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.41 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.03 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  34.06 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  29.03 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 259 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
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NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
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NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  30.18 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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