46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24520 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 184 aa  381  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  47.13 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  45.09 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  26.47 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  25.88 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  25.73 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  25.88 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  25.88 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  25.88 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3180  putative transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  25.15 
 
 		 289 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  25.37 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  23.12 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  19.77 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  24.86 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  28.16 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  21.91 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  19.88 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  31.67 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  19.88 
 
 		 184 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 189 aa  42  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 221 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 226 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  42 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>