49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1863 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1863  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.318019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  48.84 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08810  hypothetical protein  42.4 
 
 		 217 aa  167  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.239568 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  30.53 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  39.47 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  36.36 
 
 		 289 aa  48.9  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  35.09 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  35.09 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  35.09 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  35.09 
 
 		 188 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  35.09 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  35.09 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  21.11 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 211 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  35.42 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>