260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6347 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6347  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2636  regulatory protein TetR  32.78 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.79 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0091  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0611138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  25.89 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4255  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  29.76 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
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NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
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NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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