More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2488 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  433  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  33.87 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  35.48 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  49.12 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  44.44 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  39.37 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  32.23 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2865  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  39.66 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 280 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  51.02 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  59.52 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  51.02 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  40.62 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>