61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0212 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0212  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  24.5 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  26.78 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  22.29 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  20.12 
 
 		 187 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 190 aa  42  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  29.69 
 
 		 188 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  22.34 
 
 		 172 aa  42  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  20.22 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  21.25 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 182 aa  42  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 193 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 205 aa  41.6  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  19.9 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 231 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0287  hypothetical protein  21.24 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.356291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>