113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  98.1 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  72.12 
 
 		 208 aa  307  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  74.53 
 
 		 213 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  67.94 
 
 		 210 aa  288  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  69.8 
 
 		 224 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 210 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 210 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  64.59 
 
 		 211 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4970  TetR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 208 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3257  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255027  decreased coverage  0.000226088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4616  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4356  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3239  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.727709  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4626  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  28.08 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1652  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1329  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000704239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1044  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000181846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  29.12 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 264 aa  45.1  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  43.48 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 199 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.84 
 
 		 198 aa  45.1  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  40.35 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  34.82 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 74 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 215 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>