50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1652 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1652  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1329  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 246 aa  264  7e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000704239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1044  TetR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000181846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3257  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255027  decreased coverage  0.000226088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3239  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.727709  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4616  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4356  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  26.64 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4626  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  25.24 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  24.76 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4970  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  25.43 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  19.81 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 376 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  21.13 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  28.12 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  25.35 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 212 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 228 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 196 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 194 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  25.68 
 
 		 243 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 210 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>