97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0249 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  37.04 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3257  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255027  decreased coverage  0.000226088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  35.02 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 211 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  34.1 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4616  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4970  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4356  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4626  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1044  TetR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000181846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1329  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000704239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1652  TetR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3239  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.727709  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  38.27 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  24.17 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  38.1 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 199 aa  45.4  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  29.07 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 210 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  42  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 218 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 216 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 223 aa  42  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>