76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4626 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4626  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4616  TetR family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3239  TetR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.727709  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3257  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255027  decreased coverage  0.000226088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  36.59 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4970  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4356  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  32.67 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  32.67 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1652  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1044  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000181846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1329  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000704239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  23.47 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  28.85 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  34.07 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  25 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 260 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  23.26 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 227 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 216 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 243 aa  42  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  42  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  23.79 
 
 		 258 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 193 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>