103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14710 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14710  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0751499  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  26.86 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  53.33 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  36.14 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  36.89 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 252 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 239 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  68.97 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  44.83 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  30.95 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  32.69 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 210 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 207 aa  42  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  45.65 
 
 		 183 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2865  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 254 aa  41.6  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 235 aa  41.6  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>