105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4505 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 235 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  31.63 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  30.65 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  29.1 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.14 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  22.75 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  26.9 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  42.62 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  29.13 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  41.43 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>