More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0267 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0267  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614895  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  31.17 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  50.7 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  42.47 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  43.75 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  44.83 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 198 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  37.7 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 199 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 202 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37210  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  42.42 
 
 		 209 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 192 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  39.34 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>