69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1495 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  66.5 
 
 		 215 aa  250  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  66.33 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  66.33 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2780  transcriptional regulator TetR family  62.63 
 
 		 212 aa  234  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  44.33 
 
 		 215 aa  151  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  45.41 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  29.08 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  24.22 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  21.43 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  24.51 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  23.08 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  25.49 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1053  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  0.0546108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 203 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 192 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 186 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 238 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3066  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 229 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>