177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0328 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



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Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  99.53 
 
 		 215 aa  420  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  90.7 
 
 		 215 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  80.58 
 
 		 218 aa  322  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 213 aa  214  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  45.73 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  45.73 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2780  transcriptional regulator TetR family  43.26 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.49 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  27.72 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  27.5 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  23.74 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.71 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  24.5 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  27.49 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  25.64 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.63 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  26.6 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  26.73 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00480  transcriptional regulator TetR/acrR family  29.92 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
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NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.26 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
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NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  26.4 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
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NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
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NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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