42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2528 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  48.1 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  36.13 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  32.14 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  46.3 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  27.89 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  29.12 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  23.35 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  26.02 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 429 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>