More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1307 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  42.35 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  24.44 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  25.53 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32400  transcriptional regulator, tetR family  26.5 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  42.42 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.08 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.46 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3108  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  28.72 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  40.3 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>