200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1940 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 229 aa  98.2  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  28.8 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  26.55 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  27.37 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  22.11 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  25.97 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  24.5 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 280 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  24.59 
 
 		 346 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  29.21 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 125 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>