187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0967 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  99.11 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  99.11 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  99.11 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  98.66 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  85.2 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  85.2 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.2 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  84.75 
 
 		 223 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  84.75 
 
 		 223 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.46 
 
 		 225 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  54.59 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  52.51 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  52.51 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 283 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 278 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 278 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 278 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  31.89 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  28.3 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  28.79 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.3 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  48.28 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  28.66 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  26.47 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  40.3 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  42.62 
 
 		 112 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  41.18 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  42.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  42.86 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>