More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1330 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  71.3 
 
 		 236 aa  324  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  71.3 
 
 		 236 aa  324  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  53.78 
 
 		 224 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  53.36 
 
 		 223 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  53.36 
 
 		 223 aa  237  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  53.36 
 
 		 223 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  53.36 
 
 		 223 aa  238  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  53.36 
 
 		 223 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  53.36 
 
 		 223 aa  238  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  53.36 
 
 		 223 aa  238  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  53.36 
 
 		 223 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  55.05 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  54.59 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  55.05 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  55.05 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  52.91 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  52.63 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 278 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 275 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  29.61 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  29.73 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  30.21 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  33.14 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  45.16 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  48.08 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  28.16 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  42.62 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.55 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  40 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.55 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.55 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  34.55 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>