252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1287 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.46 
 
 		 224 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.46 
 
 		 224 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.46 
 
 		 224 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.46 
 
 		 224 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.46 
 
 		 224 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  76.68 
 
 		 223 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  76.68 
 
 		 223 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  76.68 
 
 		 223 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  76.68 
 
 		 223 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  76.68 
 
 		 223 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  76.68 
 
 		 223 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  76.68 
 
 		 223 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  76.23 
 
 		 223 aa  353  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  76.23 
 
 		 223 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  52.63 
 
 		 232 aa  227  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  51.54 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  51.54 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 239 aa  101  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  31.86 
 
 		 253 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  30.24 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  30.81 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.94 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  48.28 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  55.81 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  26.11 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  24.14 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  31.58 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>