More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3295 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  24.12 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 289 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 287 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 290 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 290 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 290 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 290 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 290 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  43.1 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 290 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 290 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 291 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  36.23 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>