More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3340 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  80.77 
 
 		 210 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  68.47 
 
 		 209 aa  291  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  67.49 
 
 		 209 aa  290  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  67.49 
 
 		 209 aa  290  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  67.49 
 
 		 209 aa  290  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  67.49 
 
 		 209 aa  290  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  67.49 
 
 		 209 aa  290  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  67.49 
 
 		 209 aa  290  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  67.49 
 
 		 209 aa  290  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  67.49 
 
 		 209 aa  289  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  67.49 
 
 		 209 aa  288  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  30.1 
 
 		 278 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  27.51 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  23.76 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  21.08 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.6 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  22 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  23.32 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 770 aa  55.1  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  26.85 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  21.03 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  32.71 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.13 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>