33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3486 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  98.92 
 
 		 186 aa  357  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  53.76 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  39.08 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  37.63 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 225 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  27.06 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  28.19 
 
 		 232 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 206 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 200 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 214 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>