29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3780 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Replicon accession
Locus tag
Product
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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  347  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 197 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  50.29 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  43.5 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
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NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  31.52 
 
 		 232 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 228 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 228 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 228 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
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