274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1477 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  95.3 
 
 		 235 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  95.3 
 
 		 235 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4338  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  39.7 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.69 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 198 aa  52.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  42 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 184 aa  48.9  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  34.67 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  39.18 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.48 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3709  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 98 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 273 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>