More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0595 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  43.17 
 
 
202 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 
205 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3661  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
306 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 
414 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
423 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
209 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  40.7 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  37.18 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.07 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
205 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
205 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
205 aa  48.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
220 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  39.73 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.37 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.37 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
202 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.37 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.37 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  43.14 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
242 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
195 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.37 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  37.93 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
231 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  47.06 
 
 
219 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
403 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 
237 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 
241 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.46 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 
222 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  45.83 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
218 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  45.83 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
195 aa  44.7  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  29.89 
 
 
195 aa  44.7  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
252 aa  44.7  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 
223 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
198 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>