53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03540  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 179 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  22.4 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 205 aa  45.4  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  24.46 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  29.69 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  36.51 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  31.03 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 		 193 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  20.54 
 
 		 212 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 205 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 225 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  29.25 
 
 		 193 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 207 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>