107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0836 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 199 aa  148  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 202 aa  147  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  45.96 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  48.55 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  42.78 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  52.46 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.51 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  32.75 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  38.02 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.7 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.46 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  28.46 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  44.12 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  43.86 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 429 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  53.49 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  34.21 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 414 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  26.43 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  30.37 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  26.34 
 
 		 193 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 235 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 202 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 290 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 237 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 273 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>