218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  64.77 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  52.69 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  46.86 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  42.78 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  35.94 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 178 aa  62  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  26.67 
 
 		 178 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  34.17 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  55.36 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  44.12 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  49.12 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  28.9 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  47.27 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  56 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1252  regulatory protein, TetR  38.62 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.409819  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  62.16 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  30.06 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  39.34 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  39.34 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>