48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0650 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  46.7 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  43.28 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  35.67 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 178 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  41.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  25 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  36.54 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  34.26 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  29.17 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0862  hypothetical protein  33.98 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal  0.0703318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.64 
 
 		 186 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 199 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>