91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 180 aa  98.6  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  59.68 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  37.84 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  26.09 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  56.67 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  34.19 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  28.11 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  26.37 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  46.03 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  56.25 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 234 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  46.15 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  20.24 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  28.87 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  22.04 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 213 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 182 aa  42  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 192 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 248 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 190 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  37.93 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>