More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1479 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2598  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  35.63 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  40.79 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  27.69 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 243 aa  51.6  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  36.36 
 
 		 222 aa  51.2  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4006  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.42 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.7 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0233  hypothetical protein  26.47 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.7 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.7 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 425 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>