162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5798 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  53.72 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  47.09 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  51.58 
 
 		 195 aa  121  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 194 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  51.34 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  46.62 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  28.93 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  59.18 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  52.46 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  54.17 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  41.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 236 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 241 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  24.55 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  34.43 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  46.43 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  43.14 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  35.4 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  40.68 
 
 		 241 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  23.26 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 414 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  29.2 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>