166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0929 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 180 aa  346  8e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  37.7 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 191 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  49.43 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  38.93 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  48.15 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  31.9 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  45.56 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  59.18 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  39.39 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  58.7 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  31.74 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 207 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 208 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  30.25 
 
 		 200 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 234 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 234 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  45 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 237 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 260 aa  44.3  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  31.51 
 
 		 213 aa  44.3  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  34.85 
 
 		 237 aa  44.3  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 184 aa  44.3  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 186 aa  44.3  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  39.66 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  38.71 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>