17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0348 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  69.02 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  32.08 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  46.15 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  52.5 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>